Arbeitsgruppe Prof. Dr. Mayer

Leitung

• Kontakt

Prof. Dr. Johannes Mayer

Gruppenleiter

06131 17-6920

Forschungsschwerpunkt

Arbeitsgruppe ‚Dermatological and Computational Immunology Laboratory‘

Wir nutzen modernste Technologien und Analysemethoden, um die Heterogenität von Hautkrankheiten auf Einzelzell-Ebene zu entschlüsseln.

Im Zentrum unserer Forschung stehen myeloide Immunzellen und ihre Untergruppen, die maßgeblich an der Entstehung und dem Verlauf von Hauterkrankungen beteiligt sind. Zu Beginn einer Entzündung steuern diese Zellen richtungsweisende Immunkaskaden sowie T- und B-Zell-Antworten, die den Krankheitsverlauf maßgeblich beeinflussen. Im weiteren Verlauf besitzen sie zudem das Potenzial, andere Hautzellen (sogenannte „Bystander-Zellen“) in ihrer normalen Funktion zu beeinflussen und dadurch eine Kettenreaktion auszulösen.

Um neue Therapieoptionen für diese seltenen, aber hochpotenten Zelltypen zu entwickeln, arbeiten wir mit einer Vielzahl von Zellkulturmodellen, Mausmodellen und Patientenproben. Unser Ziel ist es, die Aktivierung und Interaktion myeloider Zellen in entzündlichen Hauterkrankungen, in Hautkrebs sowie im Alter besser zu verstehen.

Nachwuchsgruppe ‚AI und maschinelles Lernen in den Lebenswissenschaften’

In unserer Arbeitsgruppe nutzen wir moderne Methoden des maschinellen Lernens und der künstlichen Intelligenz, um komplexe biologische und klinische Daten zu analysieren und neue Erkenntnisse zu gewinnen. Unter anderem liegt unser Forschungsschwerpunkt auf der Entwicklung und Anwendung von KI-basierten Ansätzen zur Qualitätssicherung in der funktionellen Genomik, sowie der Modellierung und Generierung biologischer Sequenzen. Durch den Einsatz von Deep Learning, generativen Modellen und automatisierten Qualitätskontrollen streben wir an, die Reproduzierbarkeit und Aussagekraft von Einzelzell- und Multi-Omics-Daten zu verbessern. Dies ermöglicht uns, die Rolle von Immunzellen und myeloiden Zellen in entzündlichen Hauterkrankungen und Krebs noch präziser zu verstehen und innovative Therapieansätze zu entwickeln. Bei Interesse an Kooperationen im Bereich KI-gestützter Datenanalyse oder generativer Modelle für biologische Anwendungen steht Maximilian Sprang gerne für weitere Informationen zur Verfügung

Weitere Details über unsere Forschung finden Sie auf unserer Webseite www.mayer-lab.com

Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter

• Kontakt

B.Sc. André Peter Heinen

TA/QMR

Flow Cytometry Expert

06131 17-4526

• Kontakt

Dr. Maximilian Sprang

Leading Bioinformatician/Junior Group Leader

06131 17-7858

Ausgewählte Publikationen

Mayer JU, Hilligan KL, Chandler JS, Eccles DA, Old SI, Domingues RG, Yang J, Webb GR, Munoz-Erazo L, Hyde EJ, Wakelin KA, Tang SC, Chappell SC, von Daake S, Brombacher F, Mackay CR, Sher A, Tussiwand R, Connor LM, Ortega DG, Jankovic D, Gros GL, Hepworth MR, Lamiable O, Ronchese F. (2021) Homeostatic IL-13 in healthy skin directs dendritic cell differentiation to promote TH2 and inhibit TH17 cell polarization. Nat. Immunol., 1 (13). https://doi.org/10.1038/s41590-021-01067-0

​

Sprang M, Möllmann J, Andrade-Navarro MA, Fontaine JF. (2024) Overlooked poor-quality patient samples in sequencing data impair reproducibility of published clinically relevant datasets. Genome Biol, 25(1):222.  https://doi.org/10.1186/s13059-024-03331-6 

Neuste Publikationen

Chen B & Mayer JU. (2026) Emerging Frontiers in the Mitochondrial Regulation of Dendritic Cell Biology. Redox Biol, 104032. https://doi.org/10.1016/j.redox.2026.104032 

Gabele A, Cihan M, Sprang M, Klein M, Nurbekova A, Romaniuk K, Lemmermann N, Tenzer S, Andrade-Navarro MA, Bopp T, Distler U. (2025) Protocol for mapping murine transcription factor interactomes and composite motifs combining affinity purification mass spectrometry and ChIP-seq. STAR Protoc, 6(4):104184. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2025.104184 

Cihan M, Schmauck G, Sprang M, Andrade-Navarro MA. (2025) Unveiling cell-type-specific microRNA networks through alternative polyadenylation in glioblastoma. BMC Biol, 23(1):15. https://doi.org/10.1186/s12915-024-02104-8 

Gabele A*, Sprang M*, Cihan M, Welzel M, Nurbekova A, Romaniuk K, Dietzen S, Klein M, Bündgen G, Emelianov M, Harms G, Rajalingam K, Ziesmann T, Pape K, Wasser B, Gomez-Zepeda D, Braband K, Delacher M, Lemmermann N, Bittner S, Andrade-Navarro MA, Tenzer S, Luck K, Bopp T, Distler U. (2025) Unveiling IRF4-steered regulation of context-dependent effector programs in CD4+ T cells under Th17- and Treg-skewing conditions. Cell Rep, 44(3):115407. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.115407 

Selby DA*, Jakhmola R*, Sprang M*, Großmann G, Raki H, Maani N, Pavliuk D, Ewald J, Vollmer S. (2025) Visible neural networks for multi-omics integration: a critical review. Front Artif Intell, 8:1595291. https://doi.org/10.3389/frai.2025.1595291

Cihan M, Anyaegbunam UA, Albrecht S, Andrade-Navarro MA, Sprang M. (2025) Evaluating Genetic Regulators of MicroRNAs Using Machine Learning Models. Int J Mol Sci, 26(12):5757. https://doi.org/10.3390/ijms26125757

Selby DA, Sprang M, Ewald J, Vollmer SJ. (2025) Beyond the black box with biologically informed neural networks. Nat Rev Genet, 26(6):371-372. https://doi.org/10.1038/s41576-025-00826-1

Ochiai S, Larson AR, Mayer JU, Yang J, Brewerton M, Lamiable O, Ronchese F. (2025) Allergic Skin Inflammation Drives IL-4-Dependent Differentiation of Dermal CD11b-low Dendritic Cells. J Invest Dermatol, S0022-202X(25)00536-6. https://doi.org/10.1016/j.jid.2025.05.016

Siebner AS, Habib M, Osmani V, Adegnika AA, Bogdan C, Breloer M, Elliott A, Fathi A, Hendrickx G, Nono JK, Lang R, Mayer JU, Mordmüller B, Ndungo E, Protzer U, Yazdanbakhsh M, Klug SJ, da Costa CP, Esen M. (2025). Interdisciplinary symposium on challenges and opportunities for vaccines: A comprehensive approach of current and future vaccine strategies to improve vaccine effectiveness in complex chronic infectious contexts. Vaccine: X, 23, 100615. https://doi.org/10.1016/j.jvacx.2025.100615

Ferrer-Font F, Burn OK, Mayer JU, Price KM. (2024) Immunophenotyping challenging tissue types using high-dimensional full spectrum flow cytometry. Meth Cell Biol. 0091-679X. https://doi.org/10.1016/bs.mcb.2024.02.014

Schülke S, Gilles S, Jirmo AC, Mayer JU. (2023) Tissue-specific antigen-presenting cells contribute to distinct phenotypes of allergy. Eur. J. Immunol. 0:2249980. https://doi.org/10.1002/eji.202249980

Schinner J, Cunha T, Mayer JU, Hörster S, Kind P, Didona D, Keber C, Hertl M, Worzfeld T and Juratli HA. (2023) Skin-infiltrating T cells display distinct inflammatory signatures in lichen planus, bullous pemphigoid and pemphigus vulgaris. Front. Immunol. 14:1203776. https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1203776

Möbs C, Salheiser M, Bleise F, Witt M, Mayer JU. (2023) Basophils control T cell priming through soluble mediators rather than antigen presentation. Front. Immunol. 13:1032379. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.1032379

weitere Publikationen: https://scholar.google.de/citations?user=AQGP77UAAAAJ&hl=de