Ausgewählte Publikationen

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Forschungsinteresse der Arbeitsgruppe

Methodenspektrum der Arbeitsgruppe

Mitarbeiter:innen und Projekte der Arbeitsgruppe

Delacher, M., Schmidleithner, L., Simon, M., Stüve, P., Sanderink, L., Hotz-Wagenblatt, A., Wuttke, M., Schambeck, K., Ruhland, B., Hofmann, V., Bittner, S., Ritter, U., Pant, A., Helbich, S.S., Voss, M., Lemmermann, N.A., Bessiri-Schake, L., Bohn, T., Eigenberger, A., Menevse, A.N., Gebhard, C., Strieder, N., Abken, H., Rehli, M., Huehn, J., Beckhove, P., Hehlgans, T., Junger, H., Geissler, E.K., Prantl, L., Werner, J.M., Schmidl, C., Brors, B., Imbusch, C.D. and Feuerer, M.: The effector program of human CD8 T cells supports tissue remodeling. Journal of Experimental Medicine 2024: The effector program of human CD8 T cells supports tissue remodeling: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38226976

→ Diese Forschungsarbeit zeigt, dass menschliche Effektor-CD8-T-Zellen nicht nur Zytotoxizität vermitteln, sondern auch den Gewebeumbau fördern. Das Remodellierungspotenzial wurde in verschiedenen Systemen nachgewiesen, darunter waren ein primäres Organoidmodell und antigenspezifische Tests.

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Nedwed, A.S., Helbich, S.S., Braband, K.L., Volkmar, M., Delacher, M. and Marini F.: Using combined single-cell gene expression, TCR sequencing and cell surface protein barcoding to characterize and track CD4+ T cell clones from murine tissues. Frontiers of Immunolology 2023: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37901204

→ In diesem Methodenpapier werden die Schritte beschrieben, die zur Durchführung der Einzelzell-Chromatinverfügbarkeitssequenzierung muriner CD4-T-Zellen erforderlich sind. Diese schließen Nasslaborschritte sowie bioinformatische Analysen ein.

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Braband, K.L., Nedwed, A.S., Helbich, S.S., Simon, M., Beumer, N., Brors, B., Marini, F. and Delacher M.: Using single-cell chromatin accessibility sequencing to characterize CD4+ T cells from murine tissues. Frontiers of Immunology 2023: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/370908367/

→ In diesem Methodenpapier werden die Schritte beschrieben, die zur Durchführung der Einzelzell-Chromatinverfügbarkeitssequenzierung muriner CD4-T-Zellen erforderlich sind. Diese schließen Nasslaborschritte sowie bioinformatische Analysen ein.

 

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Braband, K.L., Kaufmann, T., Floess, S., Zou, M., Huehn, J., Delacher, M.: Stepwise acquisition of unique epigenetic signatures during differentiation of tissue Treg cells. Front Immunol 2022: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36569861/

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Delacher, M., Simon, M., Sanderink, L., Hotz-Wagenblatt, A., Wuttke, M., Schambeck, K., Schmidleithner, L., Bittner, S., Pant, A., Ritter, W., Hehlgans, T., Riegel, D., Schneider, V., Groeber-Becker, F., Eigenberger, A., Gebhardt, C., Strieder, N., Fischer, A., Rehli, M., Hoffmann, P., Edinger, M., Strowig, T., Huehn, J., Schmidl, C., Prantl, L., Werner, J., Brors, B., Imbusch, C.D., Feuerer, M: Single-cell chromatin accessibility landscape identifies tissue repair program in human regulatory T cells. Immunity 2021: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33789089/

→ Hier haben wir das menschliche Gegenstück zu murinen Gewebereparatur-Treg-Zellen identifiziert und sie auf transkriptioneller und epigenetischer Ebene charakterisiert.

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Delacher, M., Barra, M. M., Herzig, Y., Eichelbaum, K., Mahmoud-Reza, R., Richards, DM., Träger, U., Hofer, AC., Kazakov, A., Braband, KL., Gonzalez, M., Wöhrl, L., Schambeck, K., Imbusch, C. D., Abramson, J., Krijgsveld, J., Feuerer, M: Quantitative proteomics identifies TCF1 as a negative regulator of Foxp3 expression in conventional T cells. iScience 2020: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32422593/

→ In dieser Forschungsarbeit wurde der Foxp3-Promotor mit Hilfe quantitativer Proteomik untersucht.

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Delacher, M., Imbusch, C. D., Hotz-Wagenblatt, A., Mallm, J. P., Bauer, K., Simon, M., Riegel, D., Rendeiro, A. F., Bittner, S., Sanderink, L., Pant, A., Schmidleithner, L., Braband, K. L., Echtenachter, B., Fischer, A., Giunchiglia, V., Hoffmann, P., Edinger, M., Bock, C., Rehli, M., Brors, B., Schmidl, C., Feuerer, M: Precursors for Nonlymphoid-Tissue Treg Cells Reside in Secondary Lymphoid Organs and Are Programmed by the Transcription Factor BATF. Immunity 2020: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31924477/

→ Hier haben wir die Entwicklungsprogramme identifiziert, die der Gewebe-Treg-Differenzierung bei Mäusen zu Grunde liegen.

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Delacher, M., Schmidl, C., Herzig, Y., Breloer, M., Hartmann, W., Brunk, F., Kagebein, D., Trager, U., Hofer, A. C., Bittner, S., Weichenhan, D., Imbusch, C. D., Hotz-Wagenblatt, A., Hielscher, T., Breiling, A., Federico, G., Grone, H. J., Schmid, R. M., Rehli, M., Abramson, J., Feuerer, M: Rbpj expression in regulatory T cells is critical for restraining TH2 responses. Nature Communication 2019: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30962454/

→ Diese Arbeit zeigt, dass ein empfindliches Gleichgewicht zwischen der Gewebeanpassung und der Unterdrückungskapazität muriner Treg-Zellen besteht.

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Delacher, M., Imbusch, C. D., Weichenhan, D., Breiling, A., Hotz-Wagenblatt, A., Trager, U., Hofer, A. C., Kagebein, D., Wang, Q., Frauhammer, F., Mallm, J. P., Bauer, K., Herrmann, C., Lang, P. A., Brors, B., Plass, C., Feuerer, M: Genome-wide DNA-methylation landscape defines specialization of regulatory T cells in tissues. Nature Immunology 2017: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28783152/

→ Diese Arbeit identifiziert den epigenetischen und transkriptionellen Fußabdruck von murinen Gewebe-Treg-Zellen und liefert Oberflächenmarker für deren Identifizierung in lymphatischen und peripheren Geweben.

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Ausgewählte Konferenzbeiträge

Ort: Frankfurt

Datum: 2. Juni 2022

Titel: Using single cell genomics to understand tissue immunology

Link zum Vortrag





Ort: virtuell

Datum: 23. September 2021

Titel: Using single cell genomics to understand tissue immunology

Link zum Vortrag 

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