Zu den Schwerpunkten der Abteilung Biometrie sowie Genomische Statistik und Bioinformatik gehören die Datenanalyse bei Forschungsprojekten zur personalisierten Medizin mit komplexen Verfahren der statistischen Modellierung und des maschinellen Lernens, u.a. unter Berücksichtigung hochdimensionaler genomischer und weiterer molekularer Marker, sowie die Sekundärnutzung von Daten. Das IMBEI beherbergt die Core Facility Bioinformatik (in Zusammenarbeit mit der I. Medizinischen Klinik).

Die Abteilungen der Epidemiologie führen bevölkerungsbezogene Beobachtungsstudien in den Bereichen Strahlenepidemiologie, Krebsepidemiologie, Versorgungsforschung und pädiatrischer Epidemiologie durch.

Die Schwerpunkte der Abteilung Medizinische Informatik sind die Themen System- und Datenintegration, Krankenhausinformationssysteme, Datenschutz, Telematik sowie Künstliche Intelligenz.

Die Abteilung Medizinische Dokumentation übernimmt zentrale Aufgaben im Datenmanagement und in der Datenerhebung.