Professur für Experimentelle Hämostaseologie und Laboratoriumsmedizin

Univ.-Prof. Dr. Sven Danckwardt

Wir sind an der Entschlüsselung genregulatorischer Prozesse interessiert, wie diese durch exogene und endogene Einflüsse moduliert werden und dies komplexe pathophysiologische Zusammenhänge - wie etwa die rätselhafte Liaison von Blutgerinnung und Tumorbiologie - zu erklären hilft. Von besonderem Interesse sind darüber hinaus die wechselseitigen Interaktionen von vaskulärer Biologie, Inflammation und Immunität.

Wir verfolgen hierbei einen translationalen Forschungsansatz, der Elemente der Grundlagen-forschung (Biochemie, Molekular- und Zellbiologie), die Modellierung von Krankheiten in Tieren und schließlich die Analyse von Patienten vereint. Durch die Verwendung neuer diagnostischer Tools wie die präklinische (molekulare) optische Bildgebung versuchen wir diese Prozesse nicht-invasiv in lebenden Organismen zu visualisieren. Unser Ziel ist es, dieses Wissen schließlich in neue therapeutische und diagnostische Konzepte einfließen zu lassen. Beispiele sind RNA Therapeutika zur Regulation des hämostatischen Systems (Nourse & Danckwardt. Pharmacol Ther 2021, Nourse et al. J Thromb Haemost 2018) sowie RNA-Signaturen als hochpotente neuartige Biomarker in der Onkologie und bei weiteren Erkrankungen (Ogorodnikov et al. Nature Comm. 2018; Marini et al. Nucleic Acids Res. 2021).

Wenn dies ihr Interesse weckt oder Sie weitere Informationen benötigen, treten Sie mit uns in Kontakt!

Forschungsschwerpunkte

• Posttranskriptionelle Regulation in der vaskulären Medizin und darüber hinaus
• Rolle der Blutgerinnung in der Tumorbiologie und darüber hinaus
• Bedeutung der RNA Regulation in der Entwicklung und bei Krankheiten (non coding RNAs, miRNAs, RNA binding proteins)

Wichtige Elemente sind hierbei genetische Mausmodelle sowie non-invasive preclinical optical imaging. Zudem entwickeln und nutzen wir next generation sequenicing (NGS)-basierte diagnostische Techniken (sCLIP, TRENDseq, miTRAP), um Mechanismen der RNA Regulation zu entschlüsseln und in großem Maßstab funktionelle RNAi Analysen durchzuführen. Wir generieren und veröffentlichen Ressourcen, die über die Grenzen unterschiedlicher Disziplinen hinweg translationale Forschungsaktivitäten fördern und stärken (z.B. TREND-DB: explore interactively the dynamic landscape of transcriptome 3'end diversification).

Kooperationspartner

Partner an der Universitätsmedizin Mainz

• Prof. Dr. Wolfram Ruf (CTH)
• Prof. Dr. Hans Christian Probst (Institut für Immunologie)
• Prof. Dr. Tomasso Gori (Zentrum für Kardiologie)
• Prof. Dr. Michael Schäfer (Klinik für Anästhesiologie)
• Prof. Dr. Wilfried Roth, Mainz (Institut für Pathologie)

Nationale Partner

• Prof. Dr. Frank Westermann (DKFZ, Heidelberg)
• Prof. Dr. Stefan Hüttelmaier (Universitätsklinikum Halle)

Internationale Partner

• Prof. Dr. Pierre Morange (Universität Aix-Marseille)
• Prof. Dr. Elisabeta Castoldi (CARIM, Maastricht)
• Prof. Dr. Hugo Ten Cate (CARIM, Maastricht)
• Prof. Dr. David-Alexandre Trégouët (Universität Bordeaux)
• Prof. Dr. Pavel Ivanov (Harvard Medical School, Boston, USA)
• Prof. Dr. Bin Tian (Wistar Institute, Philadelphia, USA)
• Prof. Dr. Wolfram Ruf (The Scripps Research Institute, USA)

Drittmittelförderung

• Deutsche Forschungsgemeinschaft (DA 1189/2-1 und GRK 1591, Universität Halle)
• Deutsche Forschungsgemeinschaft (INST 371/33-1FUGG)
• Dr. Hella Bühler Preis für Krebsforschung
• Deutsche Gesellschaft für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin (DGKL)
• Alexander von Humboldt-Stiftung

Wir sind Teil des DFG Schwerpunktprogramms 1935 "Deciphering the mRNP code: RNA-bound Determinants of Posttranscriptional Gene Regulation", des TICARDIO Ausbildungsnetzwerks (EU Horizon 2020 Programm) und des IMB Internationalen PhD Programmes.

Biografie - Sven Danckwardt

Positionen:
Seit 2014 – Leitung der CTH Plattform 'Advanced Diagnostic'
Since 2014 – Wissenschaftliche Programnleitung der CTH Nachwuchsförderung
Since 2013 – Leitung der CTH Plattform 'Non-invasive Preclinical Imaging'
Since 2012 – Professor für Experimentelle Hämostaseologie und Laboratoriumsmedizin, CTH, Universitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität, Mainz
2010 - 2011 – Junior Gruppenleiter (Wilhelm-Roux Programm), MLU Munich

Wissenschaftlicher Werdegang:
2011 – Habilitation, Universität Heidelberg
2004 - 2011 – Postdoctoral und Senior Physician Scientist, EMBL (European Molecular Biology Laboratory) + MMPU (Molecular Medicine Partnership Unit)
2002 - 2010 – Praktizierender Arzt in Hämatologie, Onkologie and Immunologie (Pädiatrie und Innere Medizin), Charité Berlin und Universität Heidelberg

Akademische Ausbildung:
2002 – Promotion (Dr. med.), Humboldt-Universität Berlin
1994 - 2001 Studium der Humanmedizin, Universität Tübingen, Humboldt-Universität Berlin, San Diego (USA)

Team - Modul Experimentelle Hämostaseologie und Laboratoriumsmedizin

Medizinische Doktoranden

• Ludwig Eder, cand. med.
• Constantia Müller, cand. med., DCF Fellow
• Jonas Niedenthal, cand. med., DCF Fellow
• Maria Elsbernd, cand. med. dent.
• Ann-Celine Mathmann, cand med.
• Sophie Hartleb, cand. med.
• Ranya Al Shekaki, cand. med. 
• Chiara Sauerbier, cand. med.
• Yaman Mouhish, cand. med.

Alumni

• Dr. Lina Schott
• Dr. Michal Levin
• Dr. rer. nat. Shazad Khokhar
• Dr. rer. nat. Anton Ogorodnikov
• Dr. rer. nat. Yulia Kargapolova
• Dr. rer. nat. Sergey Tokalov
• Dr. sc. hum. Kashif Muhammad
• Dr. rer. nat. Kathleen Mühlbach
• Dr. med. Lisa Pruschinski
• Dr. med. Lina Schott
• Dr. med. Defne Cetiner
• Ranya Al Shekaki, MSc
• Svetlana Pavicevic
• Stefano Spada

Originalarbeiten (Auswahl)

• Vacik Díaz R, Munsch G, Iglesias MJ, Pallares Robles A, Ibrahim-Kosta M, Nourse J, Khan E, Castoldi E, Saut N, Boland A, Germain M, Deleuze JF, Odeberg J, Morange PE, Danckwardt S, Tregouët DA, Goumidi L. Plasma levels of complement components C5 and C9 are associated with thrombin generation. J Thromb Haemost. 2024 Sep;22(9):2531-2542.
• Gogiraju R, Renner L, Bochenek ML, Zifkos K, Molitor M, Danckwardt S, Wenzel P, Münzel T, Konstantinides S, Schäfer K. Arginase-1 Deletion in Erythrocytes Promotes Vascular Calcification via Enhanced GSNOR (S-Nitrosoglutathione Reductase) Expression and NO Signaling in Smooth Muscle Cells. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022 Dec;42(12):e291-e310.
• Nourse J, Tokalov S, Khokhar S, Khan E, Schott LK, Hinz L, Eder L, Arnold-Schild D, Satrapa J,  Lackner KJ, Ten Cate H, Probst HC, Danckwardt S. Non-invasive imaging of gene expression and protein secretion dynamics in living mice: identification of ectopic prothrombin expression as driver of thrombosis in cancer. BioRxiv PrePrint. 2022.
• Marini F, Scherzinger D, Danckwardt S. TREND-DB-a transcriptome-wide atlas of the dynamic landscape of alternative polyadenylation. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D243-D253.
• Ma J, Klemm J, Gerardo-Ramírez M, Frappart L, Castven D, Becker D, Zoch A, Parent R, Bartosch B, Minnich K, Giovannini M, Danckwardt S, Hartmann N, Morrison H, Herrlich P, Marquardt JU, Hartmann M. Cluster of differentiation 44 promotes osteosarcoma progression in mice lacking the tumor suppressor Merlin. Int J Cancer. 2020 Nov;147(9) 2564-2577. 
• Schaupp L, Muth S, Rogell L, Kofoed-Branzk M, Melchior F, Lienenklaus S, Ganal-Vonarburg SC, Klein M, Guendel F, Hain T, Schutze K, Grundmann U, Schmitt V, Dorsch M, Spanier J, Larsen PK, Schwanz T, Jäckel S, Reinhardt C, Bopp T, Danckwardt S, Mahnke K, Heinz GA, Mashreghi MF, Durek P, Kalinke U, Kretz O, Huber TB, Weiss S, Wilhelm C, Macpherson AJ, Schild H, Diefenbach A, Probst HC. Microbiota-Induced Type I Interferons Instruct a Poised Basal State of Dendritic Cells. Cell 2020;181(5):1080-1096 e1019.
• Häuser F, Gokce S, Werner G, Danckwardt S, Sollfrank S, Neukirch C, Beyer V, Hennermann JB, Lackner KJ, Mengel E, Rossmann H. A non-invasive diagnostic assay for rapid detection and characterization of aberrant mRNA-splicing by nonsense mediated decay inhibition. Mol Genet Metab 2020;130(1):27-35.
• Panova-Noeva M, Wagner B, Nagler M, Arnold N, Prochaska JH, Eckerle S, Spronk HM, Merzenich H, Wingerter A, Schneider A, Danckwardt S, Ten Cate H, Faber J, Wild PS. Relation between platelet coagulant and vascular function, sex-specific analysis in adult survivors of childhood cancer compared to a population-based sample. Sci Rep 2019;9(1):20090.
• Hain T, Melchior F, Kamenjarin N, Muth S, Weslati H, Clausen BE, Mahnke K, Silva-Vilches C, Schutze K, Sohl J, Radsak MP, Bundgen G, Bopp T, Danckwardt S, Schild H, Probst HC. Dermal CD207-Negative Migratory Dendritic Cells Are Fully Competent to Prime Protective, Skin Homing Cytotoxic T-Lymphocyte Responses. J Invest Dermatol 2019;139(2):422-429.
• Ogorodnikov A, Levin M, Tattikota S, Tokalov S, Hoque M, Scherzinger D, Marini F, Poetsch A, Binder H, Macher-Göppinger S, Probst HC, Tian B, Schaefer M, Lackner KJ, Westermann F, Danckwardt S. Transcriptome 3'end organization by PCF11 links alternative polyadenylation to formation and neuronal differentiation of neuroblastoma. Nat Commun 2018;9(1):5331.
• Nourse J, Braun J, Lackner K, Huttelmaier S, Danckwardt S. Large-scale identification of functional microRNA targeting reveals cooperative regulation of the hemostatic system. J Thromb Haemost 2018;16(11):2233-2245.
• Kargapolova Y, Levin M, Lackner K, Danckwardt S. sCLIP-an integrated platform to study RNA-protein interactomes in biomedical research: identification of CSTF2tau in alternative processing of small nuclear RNAs. Nucleic Acids Res 2017;45(10):6074-6086.
• Steven S, Jurk K, Kopp M, Kröller-Schön S, Mikhed Y, Schwierczek K, Roohani S, Kashani F, Oelze M, Klein T, Tokalov S, Danckwardt S, Strand S, Wenzel P, Münzel T, Daiber A. Glucagon-like peptide-1 receptor signalling reduces microvascular thrombosis, nitro-oxidative stress and platelet activation in endotoxaemic mice. Br J Pharmacol. 2017;174(12):1620-1632.
• Danckwardt S, Gantzert AS, Macher-Goeppinger S, Probst HC, Gentzel M, Wilm M, Gröne HJ, Schirmacher P, Hentze MW, Kulozik AE. p38 MAPK controls prothrombin expression by regulated RNA 3' end processing. Mol Cell. 2011 Feb 4;41(3):298-310..
• Danckwardt S, Kaufmann I, Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert AS, Gehring NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W, Wilm M, Hentze MW, Kulozik AE. Splicing factors stimulate polyadenylation via USEs at non-canonical 3' end formation signals. The EMBO journal. 26:2658-2669, 2007.
• Danckwardt S, Hartmann K, Katz B, Hentze MW, Levy Y, Eichele R, Deutsch V, Kulozik AE, Ben-Tal O.The prothrombin 20209 C-->T mutation in Jewish-Moroccan Caucasians: molecular analysis of gain-of-function of 3' end processing. J Thromb Haemost. 4(5):1078-85, 2006.
• Danckwardt S, Gehring NH, Neu-Yilik G, Hundsdoerfer P, Pforsich M, Frede U, Hentze MW, Kulozik AE.The prothrombin 3'end formation signal reveals a unique architecture that is sensitive to thrombophilic gain-of-function mutations. Blood. 104(2):428-35, 2004.
• Danckwardt S, Neu-Yilik G, Thermann R, Frede U, Hentze MW, Kulozik AE. Abnormally spliced beta-globin mRNAs: a single point mutation generates transcripts sensitive and insensitive to nonsense-mediated mRNA decay. Blood. 99:1811-1816, 2002.

Reviews (Auswahl)

• Danckwardt S, Trégouët DA, Castoldi E. Post-transcriptional control of haemostatic genes: mechanisms and emerging therapeutic concepts in thrombo-inflammatory disorders. Cardiovasc Res. 2023 Jul 6;119(8):1624-1640.
• Spada S, Luke B, Danckwardt S. The Bidirectional Link Between RNA Cleavage and Polyadenylation and Genome Stability: Recent Insights From a Systematic Screen. Front Gen. 2022 Apr
• Ogorodnikov A, Danckwardt S. TRENDseq—A highly multiplexed high throughput RNA 3′ end sequencing for mapping alternative polyadenylation. Methods Enzymol. 2021;655:37-72.
• Nourse J, Danckwardt S. A novel rationale for targeting FXI: Insights from the hemostatic miRNA targetome for emerging anticoagulant strategies. Pharmacol Ther. 2021 Feb;218:107676.
• Nourse J, Spada S, Danckwardt S. Emerging Roles of RNA 3'-end Cleavage and Polyadenylation in Pathogenesis, Diagnosis and Therapy of Human Disorders. Biomolecules. 2020 Jun 17;10(6):915.
• Ogorodnikov, A, Kargapolova Y, Danckwardt S. Processing and transcriptome expansion at the mRNA 3' end in health and disease: finding the right end. Pflugers Arch 468(6): 993-1012.
• Krenzlin H, Lorenz V, Danckwardt S, Kempski O, Alessandri B. The Importance of Thrombin in Cerebral Injury and Disease. Int J Mol Sci. 2016 Jan 11;17(1):84.

TREND-DB: explore interactively the dynamic landscape of transcriptome 3'end diversification (TREND)